Ο MySQL Query Browser τρέχει στα πρόσφατα 32-bit Windows, βασισμένα στα NT, λειτουργικά συστήματα, συμπεριλαμβανομένων των Windows 2000, XP, και 2003. Δεν τρέχει σε Windows NT 4 και παλαιότερα.

Ο MySQL Query Browser εγκαθίσταται με την χρήση ενός πακέτου εγκατάστασης Windows Installer (.msi), το οποίο μπορεί να χρησιμοποιηθεί σε όλα τα λειτουργικά συστήματα Windows. Το πακέτο MSI περιέχεται σε ένα archive με την ονομασία mysql-query-browser-version-win.msi, όπου με version δηλώνεται η έκδοση του MySQL Query Browser.

Το σύστημα Windows Installer έχει ανανεωθεί με την έκδοση των Windows XP. Όσοι χρησιμοποιούν παλαιότερη έκδοση των Windows μπορούν να ανατρέξουν σε αυτό το άρθρο της Microsoft Knowledge Base για πληροφορίες που αφορούν την αναβάθμιση στην νεότερη έκδοση.

Για να εγκαταστήσετε τον MySQL Query Browser, κάντε δεξί κλικ στο αρχείο MSI και επιλέξτε Install. Αφού το πρόγραμμα εγκατάστασης σας ζητήσει τις παραμέτρους της εκγατάστασης, η εγκατάσταση θα ξεκινήσει αυτομάτως. Κατά την διάρκεια της εγκατάστασης μπορείτε να επιλέξετε, αν θέλετε, να τοποθετηθεί μια συντόμευση στο μενού Start και ένα εικονίδιο στην επιφάνεια εργασίας.

Αν έχετε πρόβλημα με την εκτέλεση του προγράμματος εγκατάστασης μπορείτε, ως εναλλακτική λύση, να κατεβάσετε ένα αρχείο a ZIP file το οποίο δεν περιέχει πρόγραμμα εγκατάστασης. Αυτό το αρχείο έχει την ονομασία mysql-query-browser-version-win-noinstall.zip. Χρησιμοποιώντας ένα πρόγραμμα διαχείρισης συμπιεσμένων αρχείων, αποσυμπιέστε το σε έναν κατάλογο της επιλογής σας. Μπορείτε να δημιουργήσετε συντομεύσεις για το MySQLQueryBrowser.exe στην επιφάνεια εργασίας ή στην quick launch bar.

Αν δεν αλλάξετε τις επιλογές εγκατάστασης, ο MySQL Query Browser θα εγκατασταθεί στον κατάλογο C:\%PROGRAMFILES%\MySQL\MySQL Query Browser 1.1\MySQLQueryBrowser.exe, όπου %PROGRAMFILES% είναι ο προεπιλεγμένος (default) κατάλογος για τα προγράμματα στο μηχάνημά σας. Για παράδειγμα αυτός ο κατάλογος μπορεί να είναι ο C:\Program Files ή ο C:\programme.