Sur Windows, InnoDB stocke les noms de bases et de tables en interne, et toujours en minuscules. Pour déplacer des bases au format binaire, entre Unix et Windows, ou le contraire, vous devez donner des noms en minuscules à toutes vos bases et tables. Un moyen simple de faire cela sous Unix est d'ajouter la ligne suivante dans la section [mysqld] de votre fichier d'options my.cnf avant de démarrer la création de tables.

set-variable=lower_case_table_names=1

Sous Windows, cette option vaut 1 par défaut.

Les fichiers de données et de logs de InnoDB sont compatibles en mode binaire sur toutes les plates-formes si le format des nombre à virgule flottante est le même. Vous pouvez déplacer une base de données InnoDB en copiant tous les fichiers concernés, que nous avons déjà listés dans la section Section 15.9, « Sauver et restaurer une base InnoDB ». Si les formats des nombres à virgules flottantes sont différents mais que vous n'avez pas utilisé les types de données FLOAT ou DOUBLE dans vos tables alors la procédure est là même : copiez juste les fichiers concernés. Si les formats sont différents et que vous utilisez de tels types de données, vous devez utiliser mysqldump et mysqlimport pour transférer les tables.

Un bon moyen d'avoir de bonnes performances est de couper le mode auto-commit quand vous importez des données dans votre base de données, en supposant que votre espace de tables possède assez d'espace pour la grande partie d'annulations (rollback) que la grande transaction importée génère. Ne faites le commit qu'après avoir importé une table entière, ou un segment de table.